在公共衛(wèi)生與臨床醫(yī)療領(lǐng)域,病原體的快速、精準(zhǔn)檢測(cè)是疾病防控與診斷的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。無(wú)論是突發(fā)的病毒性傳染病疫情,還是隱匿的細(xì)菌、真菌感染,準(zhǔn)確識(shí)別病原體并量化其存在,都直接影響著疫情控制和患者治療方案的制定。KAPA PROBE FAST 通用型 PROBE 熒光定量技術(shù)憑借其技術(shù)優(yōu)勢(shì)和性能,成為病原體檢測(cè)領(lǐng)域的精準(zhǔn)利器,在病毒、細(xì)菌、真菌等多種病原體檢測(cè)中發(fā)揮著不可替代的重要作用。
一、KAPA PROBE FAST 技術(shù)的核心優(yōu)勢(shì)賦能病原體檢測(cè)
(一)高性能聚合酶確保檢測(cè)準(zhǔn)確性與高效性
KAPA PROBE FAST 體系中的熱啟動(dòng) DNA 聚合酶是保障病原體檢測(cè)準(zhǔn)確性和高效性的關(guān)鍵。其熱啟動(dòng)特性有效避免了在反應(yīng)起始階段因引物錯(cuò)配導(dǎo)致的非特異性擴(kuò)增。在病原體檢測(cè)中,樣本背景復(fù)雜,非特異性擴(kuò)增極易干擾檢測(cè)結(jié)果,而該聚合酶的熱啟動(dòng)功能能夠確保只有與病原體核酸特異性匹配的引物才會(huì)引發(fā)擴(kuò)增反應(yīng),極大降低了假陽(yáng)性結(jié)果的出現(xiàn)概率。例如在新冠病毒檢測(cè)中,復(fù)雜的人體樣本中存在大量自身核酸以及其他微生物核酸,熱啟動(dòng)聚合酶精準(zhǔn)地識(shí)別并擴(kuò)增新冠病毒的特異性核酸序列,為準(zhǔn)確診斷提供了可靠保障。
在擴(kuò)增效率方面,該聚合酶較傳統(tǒng) Taq DNA 聚合酶具有顯著優(yōu)勢(shì),能夠以更快速度延伸 DNA 鏈,大幅縮短反應(yīng)時(shí)間。在面對(duì)突發(fā)疫情時(shí),大量樣本需要快速檢測(cè),KAPA PROBE FAST 技術(shù)可在短時(shí)間內(nèi)完成病原體核酸的擴(kuò)增,有效提升檢測(cè)通量。在常規(guī) 1kb 片段擴(kuò)增中,傳統(tǒng)酶可能需數(shù)分鐘延伸時(shí)間,而此聚合酶可在 1 分鐘內(nèi)高效完成,這使得在大規(guī)模篩查中,能夠在更短時(shí)間內(nèi)處理更多樣本,及時(shí)發(fā)現(xiàn)潛在感染者,為疫情防控爭(zhēng)取寶貴時(shí)間。
此外,該聚合酶出色的保真性也至關(guān)重要。病原體核酸序列的準(zhǔn)確擴(kuò)增是定量檢測(cè)的基礎(chǔ),若在復(fù)制過(guò)程中出現(xiàn)堿基錯(cuò)配,將導(dǎo)致定量結(jié)果偏差。KAPA PROBE FAST 的聚合酶以極低的錯(cuò)配率精準(zhǔn)復(fù)制目標(biāo)核酸序列,確保了檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,無(wú)論是對(duì)于病原體的初步篩查還是后續(xù)的病毒載量監(jiān)測(cè),都提供了堅(jiān)實(shí)的技術(shù)支持。
(二)優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液系統(tǒng)應(yīng)對(duì)復(fù)雜樣本挑戰(zhàn)
病原體檢測(cè)樣本來(lái)源廣泛且成分復(fù)雜,如痰液、血液、糞便等,這些樣本中的雜質(zhì)、抑制劑等物質(zhì)會(huì)對(duì) PCR 反應(yīng)產(chǎn)生干擾。KAPA PROBE FAST 的優(yōu)化反應(yīng)緩沖液系統(tǒng)能夠有效應(yīng)對(duì)這一挑戰(zhàn)。其成分可精準(zhǔn)維持反應(yīng)體系的 pH 穩(wěn)定,在整個(gè) PCR 循環(huán)過(guò)程中,即便溫度大幅變化,也能保證體系 pH 處于聚合酶活性最佳范圍,確保酶活性穩(wěn)定,使擴(kuò)增反應(yīng)平穩(wěn)進(jìn)行。
緩沖液中添加的特殊增強(qiáng)劑,增強(qiáng)了聚合酶與模板 DNA 的結(jié)合力,提高了擴(kuò)增效率。在檢測(cè)結(jié)核桿菌等病原體時(shí),其核酸樣本往往存在富含 GC 區(qū)域、具有復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)的情況,普通 PCR 技術(shù)在處理此類模板時(shí)容易出現(xiàn)擴(kuò)增困難的問(wèn)題。而 KAPA PROBE FAST 的緩沖液系統(tǒng)能夠增強(qiáng)對(duì)復(fù)雜模板的擴(kuò)增能力,突破常規(guī) PCR 的瓶頸,實(shí)現(xiàn)對(duì)這些病原體核酸的有效擴(kuò)增和檢測(cè),提高了對(duì)復(fù)雜樣本中病原體的檢出率。
(三)靈敏的熒光探針檢測(cè)機(jī)制實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)定量
KAPA PROBE FAST 技術(shù)搭配的高度靈敏熒光探針,如常用的 TaqMan 探針,為病原體的精準(zhǔn)定量檢測(cè)提供了有力工具。探針 5’端標(biāo)記報(bào)告熒光基團(tuán),3’端標(biāo)記淬滅熒光基團(tuán),在完整狀態(tài)下,淬滅基團(tuán)抑制報(bào)告基團(tuán)熒光發(fā)射。當(dāng) PCR 擴(kuò)增過(guò)程中,聚合酶延伸至探針結(jié)合位置,其 5’-3’外切酶活性將探針酶切,使報(bào)告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,釋放熒光信號(hào),且該熒光信號(hào)強(qiáng)度與擴(kuò)增產(chǎn)物量呈嚴(yán)格線性關(guān)系。
在病原體核酸定量中,這一機(jī)制發(fā)揮著關(guān)鍵作用。通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào),能夠快速、準(zhǔn)確測(cè)定樣本中病原體核酸拷貝數(shù)。在艾滋病病毒(HIV)感染患者的治療過(guò)程中,需要定期監(jiān)測(cè)病毒載量以評(píng)估治療效果和調(diào)整治療方案。KAPA PROBE FAST 技術(shù)能夠精準(zhǔn)檢測(cè) HIV 核酸拷貝數(shù)的變化,為臨床醫(yī)生提供可靠的依據(jù),幫助患者獲得更有效的治療。同時(shí),該熒光檢測(cè)機(jī)制高度特異性,僅當(dāng)探針與目標(biāo)序列互補(bǔ)配對(duì)時(shí)才會(huì)產(chǎn)生有效熒光信號(hào),極大降低了假陽(yáng)性結(jié)果,保障了檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。